Základní organizace odborů FN2 je jednou ze tří odborových organizací Fakultní nemocnice Plzeň.
Je začleněna, stejně jako Základní organizace FN1 pod Odborový svaz zdravotnictví a sociální péče České republiky (OSZSPČR). Ten zastřešuje Českomoravská konfederace odborových svazů (ČMKOS).
ČMKOS je začleněna do Mezinárodní organizace práce (PSI) a dalších mezinárodních odborových struktur. Třetí odborovou organizací ve FN Plzeň je Místní klub Lékařského odborového klubu (LOK).